De Veluwe en Rijntakken zijn de grootste Natura 2000-gebieden in Gelderland. Bedrijven in de nabijheid van die gebieden kunnen vergunningplichtig zijn op grond van de Natuurbeschermingswet 1998. Het Rijk heeft in 2005 de Natuurbeschermingswet ingevoerd op grond waarvan bedrijven die effect hebben op Natura 2000-gebieden, een vergunning dienen aan te vragen. Bedrijven kunnen onder andere effect hebben door geluid, licht, verontreiniging, verdroging door wateronttrekking en stikstofuitstoot. Voor stikstof is er een duidelijke norm voor wanneer sprake is van vergunningplicht. Voor de andere factoren was die duidelijkheid er niet. Met de Natura 2000-vergunningencheck wordt ook voor deze factoren duidelijk of er sprake is van vergunningplicht voor bedrijven.

Op basis van de informatie van bedrijven over hun locatie en activiteiten geeft de vergunningencheck in drie stappen duidelijkheid. De eerste stap is geautomatiseerd en geeft direct duidelijkheid aan 90% van de bedrijven wanneer deze bedrijven voor de getoetste factoren niet vergunningplichtig zijn. De vervolgstappen duren iets langer, omdat deze niet geautomatiseerd zijn. Met de Natura 2000-vergunningencheck komt er duidelijkheid of bedrijven een vergunning aan moeten vragen. Het is vervolgens de eigen verantwoordelijkheid om dat ook daadwerkelijk te doen.